• 热线电话:010-56107385

联系方式

地 址:北京市昌平区北清路生命科学园博雅CC -9号楼2层
电 话:010-56107385
传 真:
邮 箱:support@ori-gene.cn

MicroRNA测序

您现在的位置:首页 > 科研服务 > RNA领域 > MicroRNA测序

MicroRNA测序

产品描述信息

         microRNAmiRNA)是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因,而几个miRNA也可以调节同一个基因,这种复杂的调节网络既可以通过一个miRNA来调控多个基因的表达,也可以通过几个miRNA的组合来精细调控某个基因的表达。大量的研究结果表明,miRNA在正常发育过程以及疾病发生过程中具有重要的作用,在诊断和治疗领域具有广阔的应用前景。然而目前对于miRNA的研究方法主要是通过实时定量PCR以及基因芯片技术,而且重点关注的是其表达与定量,并仅仅局限于研究那些序列信息或二级茎环结构信息已知的miRNA,而无法寻找和发现新的miRNA
      基于Illumina高通量测序平台的miRNA测序技术突破了现阶段研究技术手段上的局限性,不但可以检测miRNA表达差异,而且可以研究其3’异质性,众多的isomiR(miRNA异构体)以及未发现的新的miRNA为更加灵活、深入研究miRNA提供了解决方案。

产品详细信息

1、高通量,低成本:一次测序可得到数百万条序列,单次运行可经济分析多个样品;

2、高分辨率:基于高通量测序技术能够直接从单核苷酸水平研究小分子RNA,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉和背景噪音问题,非常有利于区分相同家族以及序列极为相似的不同sRNA

3、高精准度:reads能覆盖sRNA全序列,可成功检测低丰度表达的miRNA

4、通用平台,不依赖已知信息:可进行任何物种的sRNA序列测定,既能鉴定已知的miRNA,又能预测新的miRNA

5、可重复性高:深度测序保证了抽样随机性,重复性非常好,无需重复实验

1、样品类型:完整且无污染的总RNA

2、样品需求量(单次):≥10 μg

3、样品浓度:≥200 ng/μL

4、样品纯度:OD260/280 =1.8~2.2OD260/230≥2.028S:18S≥1.5RIN≥8.0;23S:16S≥1.5 (此项要求只针对原核生物)。

【案例一】:采用新一代测序技术分析浸水24小时后的玉米种子的小RNA文库,进一步分析确认了115个已知miRNA属于24miRNA家族,并发现了167个新的玉米miRNA。使用同样的方法,再次建立小RNA文库,将获得的已知miRNA和新发现miRNA的信息与重新构建的小RNA文库进行比对,成功推测出106个新miRNA的候选靶标。研究结果显示:玉米浸水种子中存在着miRNA媒介的基因表达调控。

图1 小RNA差异表达分布图

图2 定量RT-PCR验证靶基因表达水平

图3 小RNA调控网络分析

 【案例二】:经过microRNA测序和生物信息数据分析,成功检测出不同条件下动植物(人、果蝇、土豆等)miRNA的表达差异,从而揭示了miRNA在基因调控等方面的作用机制。

[1]Li D, Wang L, Liu X, et al. Deep Sequencing of Maize Small RNAs Reveals a Diverse Set of MicroRNA in Dry and Imbibed Seeds [J]. PloS one, 2013.

[2]Yang X, Wang L, Yuan D, et al. Small RNA and degradome sequencing reveal complex miRNA regulation during cotton somatic embryogenesis [J]. Journal of experimental botany, 2013.

 

黄i大片播放器_av无码免费播放_亚洲在线av极品无码